1998年，时任安徽省常务副省长张平，率政府代表团访问澳大利亚，与西澳州政府签订了科技与教育合作协议。经双方协商，安徽省科技培训中心与西澳州中央政府理工学院(TAFE)联合成立安徽中澳科技继续教育学院。2000年，学院作为安徽大学专科教学点，开始普通高等教育招生。2003年，经安徽省人民政府批准，在安徽省科技培训中心(1984年创办)和安徽省计算中心(1979年创办)的基础上，正式成立安徽中澳科技职业学院。2010年，学院顺利通过安徽省教育厅组织的人才培养工作评估。
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